2014年6月27日、株式会社ベネッセコーポレーション(BC)は、顧客からの問い合わせにより顧客情報が社外に漏えいしている可能性を認識し、緊急対策本部を設置して社内調査を始めた。7月7日、BCからの漏えい情報であることが確認され、株式会社ベネッセホールディングス(BHD)の危機管理本部が外部の情報セキュリティ専門家を招いて緊急対策に当たった。7月15日、BCは警視庁に刑事告訴し、同日、外部の専門家による個人情報漏えい事故調査委員会を設置した。
7月17日、警視庁はBCのシステム開発・運用を担うグループ会社シンフォームの業務委託先の元社員を、不正競争防止法違反の容疑で逮捕した。元社員は、担当業務で付与されていたデータベースへのアクセス権限を使って顧客情報を抽出し、クライアントPCからUSBケーブルで私用のスマートフォンに書き出して持ち出し、名簿業者3社に売却していた。警察から提供されたデータを分析した結果、延べ約2億1,639万件の個人情報が確認され、重複を除き名寄せすると約3,504万件、人数では約4,858万人の個人情報が漏えいしたとみられた。
調査委員会は9月12日に最終報告書をまとめ、ベネッセは9月25日に概要を公表した。翌26日、経済産業省は個人情報保護法に基づき、委託先の管理監督を怠った同法第22条違反と、個人情報の管理に責任を持つ部門を置かなかった同法第20条違反を認定し、再発防止を勧告した。ベネッセは10月24日、改善報告書を経済産業省に提出した。